Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms