Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms