Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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