Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms