Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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