Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATMP50440 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATMP50440 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATMP50440 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATMP50440 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATMP50440 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATMP50440 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATMP50440 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATMP50440 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms