Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLK1P49759 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms