Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms