Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSFMP43897 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSFMP43897 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms