Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF9P41273 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms