Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms