Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCAP28676 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCAP28676 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms