Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRHP20396 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRHP20396 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRHP20396 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRHP20396 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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