Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCP1P17987 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCP1P17987 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCP1P17987 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCP1P17987 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms