Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DESP17661 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DESP17661 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DESP17661 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DESP17661 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DESP17661 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DESP17661 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DESP17661 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DESP17661 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DESP17661 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DESP17661 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms