Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFP01375 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFP01375 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFP01375 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms