Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG7O95352 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG7O95352 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG7O95352 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms