Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSVO60911 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms