Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms