Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDY1Q9Y6F8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms