Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms