Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms