Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSD3Q9NYI0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSD3Q9NYI0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms