Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9BQ9NP90 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms