Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPR88Q9GZN0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms