Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms