Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms