Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms