Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBM4Q9BWF3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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