Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms