Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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