Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms