Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms