Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms