Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MCOLN3Q8TDD5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MCOLN3Q8TDD5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MCOLN3Q8TDD5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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