Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PARP8Q8N3A8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms