Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPA2Q8IWL1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPA2Q8IWL1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms