Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms