Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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