Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms