Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms