Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST6Q15828 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST6Q15828 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST6Q15828 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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