Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms