Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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TAF11Q15544 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TAF11Q15544 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TAF11Q15544 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TAF11Q15544 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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