Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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