Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms