Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEA1Q15075 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms