Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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