Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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