Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CALCOCO2Q13137 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CALCOCO2Q13137 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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